电动三轮车动能回收办理流程因地区而异，大致如下：
首先，要确定当地对于电动三轮车动能回收是否有相关政策及允许办理的规定。
然后，准备好车辆的相关资料，如车辆行驶证、车主身份证等。
接着，前往当地指定的车辆检测机构，对电动三轮车进行检测，看其是否符合动能回收系统安装及使用的标准，包括车辆的安全性、性能等方面的检测。
之后，联系有资质安装动能回收系统的商家或机构，根据车辆情况选择合适的动能回收装置，并由其进行安装。
安装完成后，再次到检测机构进行检测，确保动能回收系统安装后车辆仍能安全正常运行且动能回收功能符合要求。
最后，携带检测合格证明等相关材料，到当地车辆管理部门或相关登记机构办理动能回收系统的备案登记等手续，完成整个办理流程。
不同地方具体要求和流程细节有差别，要以当地实际规定为准，最好提前咨询当地相关部门，避免走弯路。