以下是在小米3手机上遇到新V6系统通知栏提示有微信消息问题的一些解决方法：
检查微信通知设置：确保微信的通知功能已经开启。可以在微信的设置中找到“新消息通知”选项，并确保它处于打开状态。
清理应用缓存：有时候应用缓存会导致通知栏出现异常提示。尝试清理微信和其他相关应用的缓存数据，看是否能够解决问题。
重启手机：有时候简单的重启手机就可以解决一些临时性的软件问题，包括通知栏的异常提示。
更新或重装微信：确保你的微信版本是最新的。如果不是，尝试更新到最新版本。如果已经是最新版本，可以尝试卸载后重新安装微信。
检查系统更新：确保你的小米3手机系统也是最新的。有时候系统更新可能会修复一些已知的问题。
恢复出厂设置：如果以上方法都无法解决问题，那么最后的手段可能是恢复出厂设置。但请注意，这会删除你手机上的所有数据和设置，所以在执行此操作前，请务必备份重要的文件。
以上方法可以帮助你解决小米3新V6系统通知栏提示有微信消息的问题。如果问题依然存在，建议联系小米客服或专业的维修人员进行进一步的帮助。
